Online fakturace v roce 2026: 7 nástrojů v přímém srovnání

Dva nejpopulárnější fakturační nástroje v Česku dělají v podstatě to samé. Jeden stojí 116 Kč/měsíc. Druhý? 358 Kč/měsíc. To je 3x vyšší cena za srovnatelné funkce.

Český trh s online fakturací je plný nepřehledných ceníků, překrývajících se funkcí a marketingového šumu. Výběr správného nástroje by neměl vyžadovat vlastní tabulku v Excelu.

Otestoval jsem 7 českých fakturačních nástrojů a porovnal je podle ceny, funkcí, automatizace a toho, pro koho jsou reálně postavené. Ať už jste freelancer (OSVČ), malé s.r.o., nebo rostoucí firma, níže najdete svůj match.

Nejdřív kritéria výběru. Pak detailní rozbor každého nástroje.

Jak vybrat fakturační nástroj (a jak jsem testoval)

Správný výběr fakturačního nástroje začíná tím, že víte, co porovnávat. Rozdíl mezi nástrojem za 50 Kč a za 215 Kč často stojí na jediné funkci, kterou buď potřebujete, nebo ne.

5 hodnoticích pilířů

1. Cena – měsíční náklad při roční fakturaci, co reálně obsahuje free tarif
2. Automatizace – párování plateb s bankou, opakované faktury, automatické upomínky
3. Napojení na účetnictví – export pro účetní, kontrolní hlášení DPH, propojení s účetními programy (Pohoda, Money S3, ABRA Flexi)
4. Rychlost startu – jak rychle vystavíte první fakturu
5. Extra funkce – mobilní aplikace, API, AI funkce, unikátní odlišnosti

Všechny ceny odpovídají aktuálním publikovaným ceníkům při roční fakturaci.

Srovnávací tabulka funkcí

Nástroj	Od (Kč/měs.)	Free tarif	Auto párování plateb	Kontrolní hlášení DPH	Mobilní app	API
Fakturoid	82	Ano (5 klientů)	Ano	Jen top tarif	Ano	Ano
iDoklad	187	60denní trial	Ano (8 bank)	Ano (Oblíbený+)	Ano (4,7/5)	Ano
Vyfakturuj	160	Ano	Ano	Ano	Ano	Ano
SuperFaktura	129	30denní trial	Ano	Ano	Ano	Ano
BitFaktura	50	Ano (3 fakt./měs.)	Omezené	Ne	Ne	Ne
FLOWii	Zdarma (1 uživatel)	Ano (plné)	Základní	Ne	Ano	Omezené
mPohoda	Zdarma (100 fakt.)	Ano	Přes Pohodu	Přes Pohodu	Ano (3,8/5)	Omezené

Kdo potřebuje co

Freelancer / OSVČ: Stačí základní online fakturace. Klíčové faktory: cena a jednoduchost. Free tarify fungují, pokud máte méně než 5 klientů a vystavujete do 10 faktur měsíčně.

s.r.o. / plátce DPH: Kontrolní hlášení (kontrolní hlášení DPH) je povinné každý měsíc. Potřebujete napojení na účetní programy a přístup pro více uživatelů. To reálně zúží výběr na Fakturoid Na maximum, iDoklad Oblíbený, nebo mPohoda s Pohodou.

Rostoucí firma (5+ lidí): Integrace s CRM/skladem, API pro vlastní workflow, automatizace ve větším měřítku. Kvalita mobilní aplikace hraje roli, pokud váš tým pracuje v terénu. Podívejte se na SuperFaktura pro specifické funkce nebo iDoklad pro nejlepší mobilní zážitek.

1. Fakturoid

Fakturoid kompletně přepracoval svůj ceník v únoru 2025. Čtyři nové názvy tarifů, ořezaný free plán a ceny, které stále podstřelují každého většího konkurenta. Na trhu od roku 2009 – nejdéle fungující český fakturační nástroj.

Rozložení cen: Zdarma (free, max 5 klientů), Na lehko (82 Kč/měsíc roční), Na každý den (116 Kč/měsíc roční), Na maximum (215 Kč/měsíc roční). Nové firmy s IČO mladším než 12 měsíců mají 50% slevu na první roční platbu.

Free tarif přišel v únoru 2025 o automatické upomínky, nahrávání souborů a evidenci nákladů. To posunulo řadu uživatelů na placené plány. Nicméně Na každý den za 116 Kč/měsíc zahrnuje automatické párování plateb, upomínky a AI extrakci nákladů (100 položek za 400 Kč).

Čím vyniká: Nejširší bankovní integrace pro automatické párování plateb. WooCommerce plugin od Toret.cz, který automatizuje celý proces od objednávky po fakturu. A API, na které se denně spoléhají firmy jako Kiwi.com a Smartsupp. CEO Smartsuppu přes API zautomatizoval zpracování plateb na více trzích. Rosti.cz dokončili integraci za 4 dny.

Kde zaostává: Žádná telefonická podpora, jen e-mail a chat. Kontrolní hlášení DPH je až v tarifu Na maximum za 215 Kč/měsíc. Pokud jste s.r.o., to je vaše minimum. Hodnocení na 5nej.cz je pouhých 6/10 na základě 24 recenzí – malý vzorek ve srovnání s 9,2/10 od Vyfakturuj z většího poolu.

Jedna freelancerka hlásí, že po přechodu z Excelu zkrátila měsíční fakturaci z půl dne na 30 minut.

Nejlepší pro: Freelancery a malá s.r.o., která chtějí nejlevnější plnohodnotnou online fakturaci. Vynechte, pokud: Potřebujete telefonickou podporu nebo vestavěné CRM.

2. iDoklad

iDoklad stojí 3x víc než Fakturoid za srovnatelné automatizační funkce. Otázka zní: ospravedlní se ta přirážka?

Tři placené tarify: Základní (187 Kč/měsíc roční), Oblíbený (358 Kč/měsíc roční), Prémiový (625 Kč/měsíc roční). Všechny ceny bez DPH. Zásadní věc: 60denní bezplatné vyzkoušení tarifu Prémiový, bez nutnosti karty. To je dvojnásobek oproti konkurenci. Plus 30denní garance vrácení peněz na jakoukoli platbu.

Tarif Oblíbený (nejpopulárnější) zahrnuje automatické párování plateb u 8 českých bank, automatické upomínky a přiznání k dani z příjmu i DPH. Pět uživatelských míst je v ceně. Tarif Prémiový zvyšuje API požadavky na 75 000/měsíc a přidává prioritní telefonickou podporu s 9 uživatelskými místy.

Čím vyniká: Mobilní aplikace má hodnocení 4,7/5 v app storech – nejvyšší ze všech testovaných nástrojů. Haléřové vyrovnání automaticky zaokrouhluje platby v rámci 1 Kč. Ověření solventnosti zákazníka vám umožní zkontrolovat platební historii klienta ještě před vystavením faktury. Žádný jiný nástroj tohle nenabízí. Testado.cz hodnotí iDoklad celkovými 9,4/10, s plnými 10/10 za rozhraní i funkce.

Kde zaostává: Cena. Tarif Oblíbený za 358 Kč/měsíc nabízí zhruba stejnou automatizaci jako Fakturoid Na každý den za 116 Kč/měsíc. Položky nelze přidávat přímo při tvorbě faktury – musí nejdřív existovat v databázi. Někteří uživatelé hlásí, že rozhraní působí neintuitivně při přechodu z jiných nástrojů. A objevily se stížnosti na přístup podpory při řešení problémů s OSS DPH.

Partnerské slevy k dispozici: 50 % z první platby přes partnerské účetní, 30 % pro uživatele Money S3, 50 % pro neziskové organizace.

Verdikt: Prémiová volba s nejlepší mobilní aplikací a nejdelším trialem na trhu. Platíte ale prémiovou cenu. Spočítejte si, jestli extra funkce ospravedlní 3x vyšší náklady pro váš konkrétní workflow.

3. Vyfakturuj

Vyfakturuj tiše drží nejvyšší uživatelské hodnocení mezi českými fakturačními nástroji: 9,2 z 10 na 5nej.cz. Nedostává tolik mediálního prostoru jako Fakturoid nebo iDoklad. Čísla ale mluví jinak.

Tři tarify: Mini (160 Kč/měsíc), Ideál (300 Kč/měsíc), Pro (700 Kč/měsíc). Free tarif existuje pro uživatele s malým objemem.

Tarif Ideál pokrývá to, co většina malých firem potřebuje: automatické párování plateb, opakované faktury, upomínky a správu více firem z jednoho účtu. Můžete spravovat několik s.r.o. bez oddělených předplatných. Live chat podpora reaguje rychle a provozují Fakturopedii – vzdělávací knihovnu, která uživatelům pomáhá z nástroje vytěžit maximum.

Čím vyniká: Hodnocení 9,2/10 vychází z konzistentního dodávání: čisté rozhraní, solidní automatizace, spolehlivá podpora. Správa více firem z jednoho účtu znamená, že můžete vést dvě s.r.o. bez placení za oddělené předplatné. Pro firmy, které si cení stability nad špičkovými funkcemi, Vyfakturuj dodává bez překvapení.

Kde zaostává: Tarif Pro za 700 Kč/měsíc je na čistě fakturační nástroj hodně. Fakturoid nabízí srovnatelné funkce za zhruba poloviční cenu. Tarif Mini za 160 Kč/měsíc stojí o 38 % víc než Fakturoid Na každý den (116 Kč) za podobnou sadu funkcí. Méně pokrytí v recenzních portálech znamená méně integračních návodů a komunitních zdrojů online. Žádný výrazný odlišovač kromě samotného skóre spokojenosti.

Přímé doporučení: Nejlepší skóre uživatelské spokojenosti na trhu. Pokud spravujete více firem z jednoho účtu nebo oceňujete Fakturopedii, Vyfakturuj si svou cenu zaslouží. Jinak vám Fakturoid Na každý den dá téměř identickou funkcionalitu za 116 Kč versus 160 Kč.

4. SuperFaktura

SuperFaktura má čtyři funkce, které žádný jiný český fakturační nástroj nenabízí. SMS upomínky pro pozdní plátce. OCR extrakce dat z přijatých faktur. Vestavěná kniha jízd. A fyzické doručování faktur přes Českou poštu.

Tři tarify: Základní (129 Kč/měsíc roční), Standardní (279 Kč/měsíc roční), Prémiový (549 Kč/měsíc roční). K dispozici je 30denní trial. Přes 147 000 podnikatelů ji používá v Česku, na Slovensku a v Rakousku. Na trhu od roku 2013.

Tarif Základní už zahrnuje neomezené faktury ve 13 jazycích, automatické párování plateb s 8+ bankami (Fio, ČSOB a další), správu skladu a poštovní doručování. Tarif Standardní přidává SMS upomínky a automatické opakované faktury. Samotná SMS funkce dokáže zachránit platby, které e-mailové upomínky minou – zvlášť od klientů, kteří ignorují svou schránku.

Čím vyniká: OCR extrakce je skutečná úspora času. Naskenujte přijatou fakturu a systém automaticky vytáhne data. Kniha jízd eliminuje potřebu samostatné aplikace pro evidenci cestovních nákladů. A fakturace ve 13 jazycích z ní dělá nejsilnější volbu pro mezinárodní účtování. Testado.cz hodnotí SuperFakturu celkovými 8,9/10, přičemž integrace dostala 9,5/10 – nejvyšší dílčí skóre ze všech testovaných nástrojů.

Kde zaostává: Žádný free tarif, jen 30denní trial. Exportní formáty pokrývají pouze PDF a Excel. Za zálohy a API podporu se účtují hodinové poplatky navíc. Ruční zpracování importu je nutné pro příchozí data. Slovenský původ se občas projeví v drobnostech české lokalizace.

Nejlepší pro: Firmy, které potřebují víc než online fakturaci: OCR skenování, knihu jízd, poštovní doručování, mezinárodní účtování. Vynechte, pokud: Chcete jednoduchou, levnou fakturaci bez zbytečností.

5. BitFaktura

Nejlevnější placený fakturační nástroj na českém trhu startuje na 50 Kč/měsíc. To je míň než káva.

Pět tarifů: Micro (zdarma, 3 faktury/měsíc), Start (50 Kč/měsíc), Standard (130 Kč/měsíc), Pro (175 Kč/měsíc), Pro Plus (355 Kč/měsíc). Nejširší rozsah cenových tarifů ze všech testovaných nástrojů.

BitFaktura to drží jednoduše. Rozhraní je intuitivní. WooCommerce integrace je k dispozici. Základní opakované faktury fungují. Pro mikropodnikání s 10–20 fakturami měsíčně tarif Start za 50 Kč pokryje to podstatné bez zbytečné komplexity.

Čím vyniká: Cena. Pokud jsou vaše fakturační potřeby minimální, na nákladech se nic jiného nevyrovná. Vstupní cena 50 Kč je o 39 % levnější než další nejlevnější varianta (Fakturoid Na lehko za 82 Kč).

Kde zaostává: Žádné automatické párování plateb v tarifu Start. Žádná mobilní aplikace. Žádný přístup k API. Uživatelské hodnocení je 3/5 ve srovnáních – výrazně pod každým dalším nástrojem. Funkční propast mezi BitFaktura Start a Fakturoid Na lehko je větší, než naznačuje cenový rozdíl 32 Kč. Za 32 Kč navíc Fakturoid přidá automatické párování plateb, neomezený počet klientů, export do Pohody/Money S3/ABRA Flexi a mobilní aplikaci.

Stručné srovnání: Nejlevnější vstupní bod na trhu, ale limitace se rychle sčítají. Pokud vystavujete víc než pár faktur měsíčně, Fakturoid Na lehko za 82 Kč nabídne podstatně víc za minimální navýšení ceny.

6. FLOWii

Většina fakturačních nástrojů dělá jednu věc. FLOWii se snaží dělat všechno: online fakturaci, CRM, řízení projektů, sklad i docházku. Vše na jedné platformě. Zdarma pro jednoho uživatele.

Free tarif zahrnuje plnou fakturační funkcionalitu bez limitu na faktury. Placené plány startují na 128 Kč/měsíc (roční) pro týmy, které potřebují další uživatele. Více funkcí znamená strmější učicí křivku – počítejte s časem na nastavení.

Pro podnikatele na volné noze, který nechce platit za čtyři samostatné SaaS služby, FLOWii celý stack sjednocuje. CRM workflow přímo napojené na generování faktur. Sledování projektů propojené s fakturací. Správa skladu řeší zásoby. Evidence docházky pokrývá základy pro mzdy.

Čím vyniká: Jediný nástroj v tomto srovnání, který balí CRM, řízení projektů a evidenci docházky s fakturací za nulovou cenu pro jednoho uživatele. Pokud aktuálně platíte za Trello + CRM + fakturační nástroj zvlášť, FLOWii nahradí všechny tři a ušetří vám peníze.

Kde zaostává: Samotný fakturační modul není tak vybroušený jako u Fakturoidu nebo iDokladu. Žádné kontrolní hlášení DPH. Uživatelské hodnocení 3/5 na srovnávacích portálech naznačuje, že all-in-one přístup má své hrany. Slovensko-český původ znamená občasné lokalizační nedokonalosti v českém rozhraní.

Nejlepší pro: Podnikatele na volné noze, kteří chtějí jeden nástroj na všechno a nevadí jim vyměnit hloubku fakturace za šíři platformy. Vynechte, pokud: Potřebujete robustní online fakturaci s kontrolním hlášením DPH nebo hlubokou integrací na účetní programy.

7. mPohoda

Pokud už používáte účetní software Pohoda, přestaňte číst. mPohoda je pro vás zdarma a propojuje se přímo s vaším stávajícím systémem. Rozhodnuto.

Pro všechny ostatní: mPohoda nabízí tarif Start, který je zdarma až pro 100 faktur ročně. Bez nutnosti předplatného Pohody. Tarif Basic stojí 156 Kč/měsíc (nebo 1 880 Kč/rok), Pro pak 3 380 Kč/rok.

Integrace s Pohodou je bezešvá. Data tečou přímo do účetnictví bez exportů a importů. Pro firmy, které jsou v ekosystému Pohody, tohle eliminuje ruční předávání, které každý jiný nástroj vyžaduje. Žádné CSV exporty, žádné přepisování, žádné bolesti hlavy s odsouhlasením.

Čím vyniká: Zdarma pro uživatele Pohody, tečka. Offline režim pro oblasti bez spolehlivého připojení. Limit 100 faktur v tarifu Start je dostatečně velkorysý pro většinu mikropodnikatelů vystavujících méně než 9 faktur měsíčně. Žádný konkurenční nástroj nenabízí tuto úroveň přímé integrace s účetnictvím bez kroku exportu/importu.

Kde zaostává: Silná vazba na ekosystém Pohody. Jako samostatný nástroj konkuruje dedikovaným fakturačním platformám špatně. Mobilní aplikace má jen 3,8/5 oproti 4,7/5 u iDokladu. Pokročilé funkce v tarifu Start jsou omezené. Roční ceníková struktura (Basic za 1 880 Kč/rok, Pro za 3 380 Kč/rok) ztěžuje cenové srovnání s měsíčně účtovanou konkurencí. Po přepočtu na měsíce: Basic vychází na zhruba 157 Kč/měsíc – srovnatelné s Vyfakturuj Mini, ale s méně samostatnými funkcemi.

Verdikt: Pokud používáte Pohodu, tohle je jasná volba. Zdarma a přímo integrované. Pokud ne, podívejte se na Fakturoid nebo BitFakturu.

Slovo závěrem: Který fakturační nástroj si vybrat?

Sedm testovaných nástrojů. Tady je, kdo by měl sáhnout po čem.

Freelancer / OSVČ

• Rozpočtová volba: BitFaktura (od 50 Kč) nebo Fakturoid Zdarma (5 klientů, neomezené faktury)
• Nejlepší poměr cena/výkon: Fakturoid Na lehko (82 Kč/měsíc). Nejlepší poměr ceny a funkcí na trhu. Zahrnuje export do Pohody/Money S3, neomezený počet klientů, mobilní aplikaci.
• Vše v jednom: FLOWii (zdarma pro 1 uživatele, zahrnuje CRM, řízení projektů a docházku)

s.r.o. / plátce DPH

• Fakturoid Na maximum (215 Kč/měsíc roční). Kontrolní hlášení DPH, opakované faktury, finanční plánování a integrace GoPay/PayPal za rozumnou cenu.
• iDoklad Oblíbený (358 Kč/měsíc). Nejlepší mobilní aplikace (4,7/5), 5 uživatelských míst, telefonická podpora. Volte, pokud jste už v ekosystému Solitea.
• mPohoda. Zdarma, pokud používáte účetní software Pohoda. Přímý tok dat, nulové starosti s exportem.

Rostoucí firma (5+ lidí)

• SuperFaktura. OCR skenování faktur, SMS upomínky, poštovní doručování, fakturace ve 13 jazycích. Stavěná pro firmy s nestandardními potřebami.
• iDoklad Prémiový. 75 000 API požadavků/měsíc, 9 uživatelských míst, prioritní telefonická podpora. Nejlepší mobilní aplikace pro terénní týmy.

Celkový vítěz

Fakturoid. Nejlepší poměr ceny a funkcí pro většinu českých podnikatelů. 3x levnější než iDoklad za srovnatelnou automatizaci. 50% sleva pro nová IČO. Na trhu od roku 2009, používají ho Kiwi.com a Smartsupp.

Jeden tip k přechodu: většina nástrojů podporuje export a import dat. Před zrušením stávajícího nástroje exportujte kompletní historii faktur. Zkontrolujte, že se zákaznická data, číselné řady faktur, záznamy o platbách a šablony opakovaných faktur přenesou čistě. Přechod typicky zabere jedno odpoledne.

FAQ

Je online fakturace v Česku legální? Potřebuji digitální podpis?

Ano, plně legální. Elektronický podpis není pro standardní faktury vyžadován. Každý nástroj v tomto srovnání automaticky vyplní všechna zákonem požadovaná pole (IČO, DIČ, data, částky).

Můžu přejít z jednoho fakturačního nástroje na jiný?

Ano. Většina nástrojů podporuje CSV nebo XML export. Exportujte všechno před zrušením. Zkontrolujte číselné řady faktur, záznamy o platbách klientů a šablony opakovaných faktur. Přechod typicky zabere jedno odpoledne.

Potřebuji fakturační nástroj, když už mám účetní?

Ano. Fakturační nástroj vytváří a odesílá faktury, sleduje platby a posílá upomínky. Účetní zpracovává data pro daně. Většina nástrojů exportuje přímo do Pohody, Money S3 nebo ABRA Flexi.

Co je kontrolní hlášení DPH a potřebuji ho?

Kontrolní hlášení je povinné pro plátce DPH. Právnické osoby (s.r.o.) podávají měsíčně. OSVČ mohou podávat čtvrtletně. Fakturoid ho zahrnuje v tarifu Na maximum (215 Kč/měsíc). iDoklad od tarifu Oblíbený (358 Kč/měsíc).

Stačí mi free tarif?

Pro freelancery s několika stálými klienty ano. Fakturoid Zdarma podporuje 5 klientů s neomezenými fakturami. mPohoda Start umožňuje 100 faktur ročně. FLOWii nemá limit na faktury pro jednoho uživatele. Nicméně free plány postrádají automatické párování plateb a upomínky. Jakmile překročíte 10 faktur měsíčně, placený plán se vám vrátí v ušetřeném čase.

Vyplatí se roční fakturace?

Téměř vždy. Fakturoid Na maximum klesne z 393 Kč na 215 Kč/měsíc při roční fakturaci (úspora 45 %). SuperFaktura ze 169 Kč na 129 Kč (24 %). iDoklad Prémiový ze 750 Kč na 625 Kč (17 %). Začněte měsíčně nebo s free trialem. Jakmile nástroj sedne, přepněte na roční platbu.